El financiamiento de las actividades de investigación, innovación y desarrollo tecnológico dirigidas a favorecer la competitividad del sector agropecuario y agroindustrial y que atienden las demandas técnicas por cadena y por regiones debe seguir los principios de priorización y focalización; lo que significa identificar las áreas estratégicas o prioritarias y las regiones con mayor producción en términos de valor o hectáreas, para lograr una optimización de los recursos. Este proceso se realiza mediante esquemas concursales con el fin de mejorar la transparencia al eliminar el mecanismo de contratación directa, además de permitir concertar la demanda y hacer eficiente la asignación de los recursos.                                                                   

El MADR ha ido afianzando y fortaleciendo el proceso de asignación de los recursos a través del mecanismo de fondo concursal. El progreso de la estrategia se nota en algunos datos numéricos de avance:

Con la figura de la alianza, en la que participan de la mano empresas del sector productivo con universidades o centros de investigación, se generan dinámicas de solución conjunta de los problemas entre academia y sector productivo, a la vez que se permiten espacios para que el sector agropecaurio reconozca las capacidades nacionales en investigación. La entidad de investigación garantiza estándares de calidad técnica para el trabajo realizado y genera dinámicas de continuidad en la investigación. Con la entidad del sector productivo se incrementan las opciones de adopción por parte de los productores, que en últimas son los que introducen al mercado las innovaciones derivadas de los proyectos, y se motivan para que estos inviertan en ciencia y tecnología. Además, se ha logrado la participación de otras entidades que colaboran en las actividades de investigación, como son las Gobernaciones y Secretarias de Agricultura, los municipios y los Centros Provinciales de Gestión Agroempresarial – CPGA -, entre otros, cuya participación ha permitido generar sinergias entre instituciones de investigación con asociaciones de productores, e incluso apalancar recursos adicionales de los gobiernos departamentales y municipales. >